Karakterisasi Fenotip dan Indeks Similaritas Isolat Actinomycetes yang Memiliki Kemampuan Antibakteri terhadap Escherichia coli dan Staphylococcus aureus

Authors

  • Wahyu Nur Sulistyanto Program Studi Biologi, Jurusan Biologi, Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Surabaya. http://orcid.org/0000-0001-7429-6957
  • Guntur Trimulyono

DOI:

https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2019.007.03.4

Keywords:

Karakteristik, Indeks similaritas, Actinomycetes, Antibakteri

Abstract

Eksplorasi kandidat mikrobia penghasil antibiotik semakin meningkat sebagai solusi banyaknya bakteri resisten terhadap antibiotik yang telah ada. Pada penelitian sebelumnya telah didapatkan empat isolat Actinomycetes yaitu ACB34a, ACB44c, ACB54c dan ACB55c yang memiliki kemampuan antibakteri, sehingga diperlukan identifikasi jenis isolate sampai tingkat Genus. Tujuan penelitian ini adalah mengidentifikasi jenis isolat yang terpilih (ACB34a, ACB44c, ACB54c dan ACB55c) berdasarkan karakteristik fenotip, dan menentukan indeks similaritas antarisolatnya. Identifikasi isolat dilakukan menggunakan karakter fenotip yang meliputi morfologi, fisiologi, biokimia dan dilanjutkan pengolahan numerik. Analisis data secara deskriptif dan numerik menggunakan Clad97. Hasil penelitian menunjukkan dua isolat Actinomycetes (ACB34a dan ACB55c) memiliki kemiripan dengan Genus Actinomadura. Sedangkan dua isolate berikutnya, yaitu ACB44c dan ACB54c masing-masing mirip dengan Genus Nocardia dan Streptomyces. Nilai indeks similaritas antara isolat ACB34a dan ACB55c adalah 0,856, selanjutnya isolat ACB54c dan ACB44c memiliki kesamaan 0,788, dan isolat ACB55c dan ACB34a memiliki kesamaan sebesar 0,7788.

Author Biography

Wahyu Nur Sulistyanto, Program Studi Biologi, Jurusan Biologi, Fakultas Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Surabaya.

Nama Wahyu Nur Sulistyanto, S.Si, Program Studi Biologi FMIPA UNESA. Bidang Minat dan konsentrasi Mikrobiologi. Tinggal di Kamal Bangkalan.

References

Aditi FY, Rahman SS, Hossain, MM (2017) A study on the microbiological status of mineral drinking water. The Open Microbiology Journal 11: 31-44.

Khanna M, Renu S, Rup L (2011) Selective isolation of rare actinomycetes producing novel antimicrobial compounds. International Journal of Advanced Biotechnology and Research 2(2): 357-375.

Geetanjali, Pranay J (2016) Antibiotic production by rhizospheric soil microflora - A review. International Journal of Pharmaceutical Sciences and Research 7(11): 4304-4314.

Krismawati H, Langkah Sembiring, Subagus W (2015) Streptomycetes penghasil antibiotik yang berasosiasi dengan rhizosfer beberapa spesies Mangrove. Plasma 1(2): 59-70.

Sulistyanto WN, Trimulyono G (2019) Isolation and antibacterial activities of Actinomycetes from rhizosphere plant cane (Saccharum officinarum) on Escherichia coli and Staphylococcus aureus. Bioedukasi 17(1): 17-24.

Julisaniah NI, Liliek S, Arifin NS (2008) Analisis kekerabatan Mentimun (Curcumis sativus L) menggunakan metode RAPD-PCR dan isozim. Biodiversitas 9 (2): 99-102.

Mohseni M, Norouzi H, Hamedi J, Roohi A (2013) Screening of antibacterial producing Actinomycetes from sediment of the Caspian Sea. International Journal of Molecular and Cellular Medicine 2(2): 64-71.

Prasetya IAW (2016) Isolasi dan karakterisasi bakteri kitinolitik endofit pada tanaman Bawang Merah (Allium ascalonicum) dan potensinya dalam menghambat pertumbuhan Fusarium oxysporum. Skripsi. Surabaya: Universitas Negeri Surabaya.

Sateesh V, Naikpatil JL, Rathod (2011) Selective isolation and antimicrobial activity of rare Actinomycetes from Mangrove sediment of Karwar. Journal of Ecobiotechnology 2 (10): 48-53.

Akond MA, Jahan MN, Nigar S, Farhana R, (2016) Effect of temperature, pH and NaCl on the isolates of Actinomycetes from straw and compost samples from Savar, Dhaka, Bangladesh. American Journal of Microbiology and Immunology 1(2): 10-15.

Hemraj V, Diksha S, Avneet G (2013) A review on commonly used biochemical test for bacteria. Innovare Journal of Life Science 1(1): 1-7.

Balai KIPM Kelas I Surabaya (2016) Protokol Instruksi Kerja. Sidoarjo: BKIPM Kelas 1 Surabaya.

Barrow GI, Feltham RKA (1993) Cowan and Steel’s manual for the identification of medical bacteria (Third Edition). UK: Cambridge University Press.

Usman WS (2015) Bakteri asosiasi karang yang terinfeksi penyakit Brown Band (BRB) di perairan Pulau Barranglompo Kota Makassar. Skripsi. Makasar: Universitas Hasanuddin.

Tantu W, Reiny AT, Sammy NJL (2013) Deteksi keberadaan bakteri Aeromonas sp. pada Ikan Nila yang dibudidayakan di karamba jaring apung Danau Tondano. Jurnal Budidaya Perairan 1(3): 74-80.

Rohmanita SA, Ardyati T, Gama ZP, Nakagoshi N (2013) Identifikasi dan analisis Bacillus thuringiensis isolat lokal Jawa Timur yang berpotensi mengendalikan pertumbuhan larva Aedes aegypti. Biotropika: Journal of Tropical Biology 1(5): 226-230.

Athalye M, M Goodfellow, Lacey J, White RP (1985) Numerical classification of Actinomadura and Nocardiopsis. Journal of Systematic Bacteriology 35 (1): 86-98.

Holt JG, Sneath, PH, Krieg, Noel R (1994) Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology: Ninth Ed. USA: William and Walkins Baltimore.

Pujiati, (2014) Isolasi Actinomycetes dari tanah kebun sebagai bahan petunjuk praktikum mikrobiologi. Jurnal Flore 1(2): 42-46.

Armaida E, Siti K (2016) Karakterisasi Actinomycetes yang berasosiasi dengan Porifera (Axinella spp.) dari perairan Pulau Lemukutan Kalimantan Barat. Jurnal Protobiont 5 (1): 68-73.

Nurkanto A, Andria A (2015) Identifikasi molekular dan karakterisasi morfo-fisiologi Actinomycetes penghasil senyawa antimikroba. Jurnal Biologi Indonesia 11 (2): 195-203.

Al-Alsaadi A, Noora MH, Eman MJ (2013) Isolation and identification of Streptomyces from different sample of soils. Journal of Biology and Medical Science 1: 31-36.

Jawetz M, Adelberg (2007) Mikrobiologi Kedokteran. EGC: Jakarta. 165-174.

Valenzuela-cova JF, Cudberro CP, Hector SH, Lorena CG, Carlos AVC, Hiram OD (2005) Biochemical identification and molecular characterization (PCR-RFLP) of Nocardia Isolates from sputum. Archives of Medicine Research 36: 356-361.

Nursulistyarini F, Erny QA (2014) Isolasi dan identifikasi bakteri endofit penghasil antibakteri dari daun tanaman Binahong (Anredera cordifolia (Ten.) Steenis). Seminar Nasional XI Pendidikan Biologi FKIP UNS. Surakarta: UNS.

Rahardi B, Arumingtyas EL, Firdaus W (2012) Constructing phenetic and phylogenetic relationship using Clad97. Journal of Tropical Life Science 2(1): 15-20.

Cohan FM (2002) What are bacterial species? Annual Review of Microbiology 56: 457-487.

Kelley RW, Kellogg ST (1978) Computer-assisted identification of anaerobic bacteria. Applied and Environmental Microbiology 35(3): 507-511.

Zulaika E, Rositawati DN (2016) Keanekaragaman bakteri pelarut fosfat dari kawasan Mangrove Wonorejo dengan pendekatan taksonomi numerik fenetik. Seminar Nasional Biodiversitas VI, Surabaya 3 September 2016.

Downloads

Published

2019-12-31

Issue

Section

Articles